El Golfo de Fonseca es una extensión de agua del Océano Pacífico, considerada como “Un verdadero mar interior que se encuentra situado entre los 12° 54’ y 13° 30’ latitud Norte y entre 37°00’ y 88°00’ longitud Oeste. El Golfo de Fonseca y su litoral tienen una superficie aproximada de 5,776 kilómetros cuadrados, localizados en el extremo Sur de los departamentos de Valle y Choluteca, sus condiciones climáticas están determinadas por los fenómenos atmosféricos propios de los trópicos y subtrópicos. La temperatura promedio de la zona baja es de 38 grados centígrados y de 21°C. en las zonas mas altas. En los meses de marzo y abril se registran las temperaturas más altas y las mas bajas se presentan en los meses de noviembre y diciembre. La precipitación promedio anual varía entre los 1,500 y 2,000 milímetros (mm).

La Bocana del Golfo tiene una extensión de 19.33 millas naúticas (35 Km) que se extiende, en línea recta, desde punta de Amapala en la República de El Salvador hasta Punta Cosigüina en Nicaragua.

El sistema hidrográfico más importante que desemboca en el Golfo de Fonseca es el Río Choluteca con una cuenca de 7,664 kilómetros. De las 112,492 Km2 del territorio Nacional, el área de la vertiente del Pacífico que drena al Golfo de Fonseca es aproximadamente 15,000 Km2 (13.38%).

El bosque de manglar existente en la zona Sur, de la República de Honduras se localiza en la faja costera de los Departamentos de Valle y Choluteca, que cuenta con una superficie de 713.3 Km2 (49% del bosque manglar en Honduras) los cuales son bañados periódicamente por los 65 esteros existentes (24 en la Bahía de Chismuyo, 19 en la Bahía de San Lorenzo y 22 en la Bahía de Fonseca) la comunidad del manglar se describe como vegetación Litoral Hidrófila formada por bosques matorrales, existiendo 3 tipos de manglares en fajas, denso y bajo.

La bahía de Fonseca fue descubierta por los Españoles en nombre de la corona de España, quién ejerció su soberanía territorial sobre ella durante casí 300 años. Más tarde otro estado sucedió a la corona Española. La República Federal de Centro América que duró 14 años, con su desnombramiento, 3 estados se constituyeron como ribereños de la Bahía, sustituyendo, en el ejercicio de competencia territorial a la República Federal.